Når man bygger, vil der altid være en påvirkning af miljøet. Derfor etablerer man en række overvågningstiltag, der skal hjælpe med at vurdere, om der er påvirkninger og hvor store påvirkningerne er.

Før det første anlægsarbejde ved Lynetteholm gik i gang, blev der gennemført en række forundersøgelser af biologien og af havbunden på et stort antal stationer i selve anlægsområdet og i de tilgrænsende områder. Dette arbejde resulterede i en baselinerapport, som udgør det udgangspunkt, som denne rapport skal holdes op imod.